O Conselho Diretor (CD), órgão máximo da Fundação Universidade Federal de Sergipe, tem por finalidade exercer a administração da fundação e superintender as atividades financeiras da Universidade Federal de Sergipe. 

O CD é constituído de 6 (seis) membros e 6 (seis) respectivos suplentes nomeados pelo presidente da República, escolhidos dentre pessoas de ilibada reputação e notória competência assim especificados:

I. 3 (três) membros e suplentes de livre escolha do chefe do Poder Executivo Federal;

II. 1 (um) membro e suplente indicados pelo Ministro da Educação;

III. 1 (um) membro e suplente indicados pelo governador do Estado de Sergipe;

IV. 1 (um) membro e suplente indicados pelo presidente da Petrobras;

§1° - Os membros do Conselho Diretor exercerão o mandato por 6 (seis) anos, podendo ser reconduzidos uma só vez.

§2º - O Conselho Diretor será renovado em um terço (1/3) a cada 2 (dois) anos.

§3º - O mandato de membro do Conselho Diretor será considerado extinto nos seguintes casos:

a) morte;

b) renúncia;

c) invalidez comprovada;

d) ausência sem justificativa a 3 (três) reuniões consecutivas;

e) procedimento incompatível com a dignidade das funções assegurada ampla defesa.

§4º - Nos casos de vaga, ausência e impedimento assumirá o respectivo suplente.

Componentes do Conselho Diretor

Titulares:

1) Ancelmo de Oliveira

Representante: Presidência da República

2) Eduardo Antônio Conde Garcia

Presidente do Conselho Diretor (26.09.2013)

Representante: Presidência da República

3) Eugênio Dezen

  Representante: Petrobrás

4) Henrique Batista e Silva

Representante: Presidência da República

5) José de Oliveira Júnior

Representante: Governo do Estado de Sergipe

6) Tadeu Cunha Rebouças

Vice-presidente  (26.09.2013)

Representante: Ministério da Educação

Suplentes:

1) Paulo Roberto Dantas Brandão

Representante: Presidência da República

2) Izaura Lúcia da Fonseca Sobral

Representante: Presidência da República

3) José Marcelo Luvizotto   

Representante: Petrobrás

4) Vera Lúcia Alves França

Representante: Presidência da República

5) José Fernandes de Lima                 

Representante: Governo do Estado de Sergipe

6) Ricardo Oliveira Lacerda de Melo

Representante: Ministério da Educação

Inserido em 07/12/2011.