Pró-Reitoria de Planejamento - PROPLAN
Órgão central do sistema de planejamento da UFS.
Pró-Reitoria de Administração - PROAD
Órgão encarregado do planejamento, coordenação, supervisão e execução das atividades de administração, recursos financeiros e materiais da UFS.
Pró-Reitoria de Graduação - PROGRAD
Órgão responsável pela coordenação geral dos cursos de graduação da UFS.
Pró-Reitoria de Pós-Graduação e Pesquisa - POSGRAP
Órgão encarregado pelo planejamento, coordenação, supervisão, integração e divulgação das atividades de pesquisa e didático-científicas relacionadas com o ensino da Pós-Graduação lato-sensu e stricto-sensu presenciais.
Pró-Reitoria de Extensão e Assuntos Comunitários - PROEX
Órgão encarregado do planejamento, coordenação e supervisão da atividade de extensão acadêmica da UFS.
Pró-Reitoria de Assuntos Estudantis - PROEST
Órgão de planejamento, coordenação e supervisão de apoio ao estudante, visando a integração, assistência e a promoção estudantil como processo pedagógico.
Pró-Reitoria de Gestão de Pessoas - PROGEP
Órgão responsável pela administração e desenvolvimento do capital humano da UFS.